La diferencia de este fenómeno con una epidemia, es que este último generalmente alude a la aparición de una enfermedad de tipo infecciosa que se contagia de forma rápida dentro de un territorio o población en específico, sin embargo limitada. Por otro lado se tiende a confundir este término endemia con la pandemia, pero se diferencia debido a que una pandemia puede describirse como una epidemia generalizada, es decir puede afectar a más de un continente.
Ejemplos de endemias pueden ser el caso de la malaria en países tropicales o de clima cálido como en África, países de América o el Sudeste asiático. En el continente americano existe un caso particular de endemia en Brasil, que es la fiebre amarilla del Amazonas. Es importante mencionar que durante el periodo de infestación de la enfermedad, es estrictamente obligatorio realizar la vacunación correspondiente antes de visitar el lugar o la región infectada.
