Fue descubierta, principalmente, por Ernest Rutherford, que detalló el momento en el las partículas alfas eran disparadas con gas nitrógeno, los detectores de centelleo mostraban los signos de los núcleos de nitrógeno, es decir, el núcleo estaba formado por protones. Originalmente se creía que era una partícula elemental, pero en el año 1970 se probó que era una partícula compuesta por tres partículas elementales de espín. Cuando se fusiona con el neutrón, se convierten en nucleones, y conforman el núcleo de los átomos.
Cuando experimentan una gran fuerza nuclear se llaman hadrones, y de la clasificación de éstos, se llama bariones, y se consideran los más ligeros. Aunque numerosas pruebas se han realiza la desintegración espontánea de un protón libre no se ha observado aún.
El protón se caracteriza por tener una carga positiva, pero, también, existe un antiprotón, el cual es una antipartícula, es decir, un protón pero con una carga negativa. Es una partícula que es estable en el vacío y no se desintegra espontáneamente. Fue descubierta en el año 1955, por Emilio segre y Owen Chamberlain, de la Universidad de California. Al colisionar con un protón se vuelven mesones, y la vida de éstas partículas es muy corta.
