Es importante su funcionamiento en el cuerpo humano, ya que afecta el estado de ánimo, como el comportamiento social, en estudios resientes se ha demostrado que ayuda a la capacidad de la paciencia, como el apetito, el sueño, la digestión, la memoria y en el nivel del deseo o libido sexual como el desempeño de este en una persona. El aumento de la serotonina en el cuerpo provoca el síndrome de serotoninérgico y si disminuye lo relacionan con los ataques depresivos. Al transmitir señales entre las neuronas, su desempeño es óptimo al regular su intensidad en el sistema nervioso central; como la producción de la leche materna ricas en nutrientes para el recién nacido, y en la gestación ayuda a la regeneración hepática y la división celular.
El órgano más importante y del cual se beneficia, es el cerebro ya que la mayoría de las células se encuentran allí, que al no estar en buen funcionamiento causa el síndrome de serotonina, que es la estimulación excesiva del sistema nervioso central, que normalmente es causado por el consumos de drogas ilegales, o cuando se combinan medicamentos para la migraña y antidepresivos, produciendo agitación, confusión, diarreas en algunos casos, taquicardias, mala visión al dilatarse la pupila, sudoración excesiva, escalofríos o fiebres altas, la musculatura falla ya sea con flacidez o rigidez de los músculos, dolores de cabezas, convulsiones y perdidas del conocimiento, en mayor grado su peligrosidad en el organismo humano de este síndrome es la muerte.