El tamaño de estos orgánulos es de un diámetro aproximadamente. Su principal función es el de intervenir en el proceso del metabolismo fermentativo de algunos seres escogidos para adquirir ATP (molécula de energía) en circunstancias de falta de oxígeno. Cabe destacar que esta función es similar a la respiración mitocondrial que ejecutan los microorganismos anaeróbicos. En ellos se descomponen los ácidos pirúvicos, que son las moléculas esenciales dentro el metabolismo, se encuentra justamente en el centro de las vías para la obtención de energía de todos y cada uno de los seres vivos. La descomposición de los ácidos pirúvicos es un proceso llevado a cabo por el hidrogenosoma que absorbe CO2, acetato el cual es expulsado al citoplasma celular.
Ahora bien, el proceso explicado con anterioridad podría describir la evolución de las mitocondrias, sin embargo esto se debe averiguar muy minuciosamente, ya que no se sabe con exactitud si las mitocondrias y los hidrogenosomas son orgánulos que han ido evolucionando en conjunto. Específicamente, habría que investigar si los hidrogenosomas cuentan con cadenas de transporte de electrones. Esto es singularmente importante ya que dentro del proceso de respiración se encuentra comprometido el transporte de hidrógeno. Ahora, si ambos orgánulos, emplean proteínas similares, se puede deducir que están vinculados y al contrastar estas proteínas con los bacterianos semejantes, se podrá saber realmente si los hidrogenosomas se derivan de las mitocondrias o por el contrario, presentan orígenes independientes.
Finalmente se debe agregar que el descubrimiento de estos orgánulos fue hecho en la época de los años 70.